STAJ ha criticado duramente al Tribunal Superior de Justicia de Andalucía (TSJA) por las apreciaciones contenidas en su memoria 2012 sobre el control de horarios al personal de los juzgados. El informe anual señalaba que el control es "más aparente que real" y "casi inexistente". El TSJA incluye estas valoraciones en un apartado de "ejemplos llamativos de disfunciones en el entorno laboral" en su informe.
Estas líneas han provocado malestar entre los funcionarios. STAJ describe el informe como "un ataque gratuito al colectivo de trabajadores de la Administración de Justicia en Andalucía".
"Tenemos que recordar que tanto jueces, fiscales y secretarios no tienen sistema de control horario alguno. Pueden, a su justo criterio, realizar las horas de trabajo que estimen convenientes mientras se nos acusa de absentismos", señala Meli Mogrera, responsable de STAJ Almería. "Es inaceptable faltar al respeto a los trabajadores con semejantes demagogias e insidias".